Στα πλαίσια του λοιμωξιολογικού ιατρείου γίνεται εργαστηριακός έλεγχος, σε συνεργασία με το μικροβιολογικό εργαστήριο του νοσοκομείου, διάγνωση, αντιμετώπιση και παρακολούθηση ειδικών παιδικών λοιμώξεων όπως:
- Συγγενείς λοιμώξεις νεογνών (συγγενής CMV λοίμωξη , συγγενής τοξοπλάσμωση κλπ)
- Υποτροπιάζουσες λοιμώξεις (δέρματος, αναπνευστικού, υποτροπιάζων /παρατεινόμενος πυρετός, εμμένουσες ή ανθεκτικές στη θεραπεία παρασιτώσεις κλπ)
- Λοιμώξεις σε ειδικές ομάδες παιδικού πληθυσμού (ανοσοκατεσταλμένους, ογκολογικούς, ρευματολογικούς ασθενείς κλπ.)
- Ειδικές λοιμώξεις (φυματίωση, ηπατίτιδα, γρίπη κλπ.)
Επιπλέον το ιατρείο έχει αντικείμενο την αντιμετώπιση σπάνιων περιπτώσεων πολυανθεκτικών λοιμώξεων στα παιδιά, συνήθως σε ειδικές ομάδες πληθυσμού.
Άλλο αντικείμενο του τμήματος είναι η ταξιδιωτική ιατρική αφενός προληπτικά, πριν το ταξίδι, όσον αφορά χημειοπροφύλαξη και ανοσοποίηση, κι αφετέρου ως εκτίμηση μετά το ταξίδι στα πλαίσια ελέγχου παιδικών λοιμώξεων των ταξιδιωτών, όπως ελονοσία, πυρετός Δ. Νείλου, παρασιτώσεις κ.λπ.
Τέλος το ιατρείο παρέχει συμβουλευτική εμβολιασμών σε ειδικές κατηγορίες παιδικού πληθυσμού, όπως ταξιδιώτες και ανοσοκατεσταλμένοι, πάντα σε συνεργασία με τον προσωπικό παιδίατρο.